Наиболее лучшим вариантом будет полностью разобрать кровлю, после чего демонтировать старые стропила и поставить новые. В противном случае, если менять частично, то вредители будут переходить на новое дерево. А вообще рекомендую рассмотреть металл в качестве стропил. Можно заказать уже готовые металлоконструкции тут http://ivacon.ru/services/metallokonstruktsii/ , четко под крышу, их точно живность не съест.